Os mais graves contaminantes  são:

Contaminantes orgânicos: São biodegradáveis e provêm da agricultura como os adubos e das descargas domésticas papel, águas com detergentes etc . Se acumulados em excesso produzem a eutrofização das águas (excesso de nutrientes numa massa de água, provocando um aumento excessivo de algas e baixa  de Oxigênio).

Contaminantes biológicos: São todos aqueles microrganismos capazes de provocar doenças. Contaminantes químicos: Os mais perigosos são os resíduos tóxicos, como os pesticidas do tipo DDT (chamados organoclorados), porque eles tendem a se acumular no corpo dos seres vivos. São também perigosos os metais pesados (chumbo, mercúrio) utilizados em certos processos industriais, por se acumularem nos organismos.

O Cloro não pode ser considerado contaminante pois a sua função é limpar a água, porém em contato com contaminantes orgânicos (principalmente vegetais) geram os Trihalometanos – que são agentes cancerígenos.